Всегда ставил по отдельности Apache, PHP и MySQL и никогда не чувствовал себя ущербным. При том, что это еще полезно для более глубокого понимания процесса работы. И не зависишь ни от каких третьих программистов. Что сам руками в конфиг впишешь, то и получишь
